태그>gaussian(총 18개의 글)
'gaussian' 관련 최근글
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- 결합의 형성에 따른 전자밀도의 변화
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/10/04 23:13
대학교 일반화학 과정에서 화학결합의 본질에 대해 가르칠 때 수소 분자를 예로 들어서 설명하는 경우가 많다. 수소 분자는 양성자 2개와 전자 2개로 이루어진 분자이온인데, 양성자 2개가 서로를 밀쳐내지 않고 일정한 거리를 유지할 수 있는 이유는 바로 전자들이 양성자들 사이에 ..
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- Gaussian scratch 설정
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/09/12 20:06
Gaussian scratch 설정이 잘못되어있으면 이런 결과가 나온다. [highhill@cluster phthalocyanin_HF]$ /opt/gaussian/g09/g09 < phthalocyan_1.dat Entering Gaussian System, Link 0=/opt/gaussian/g09/g09PGFIO/stdio: No such file or directo..
- Gaussian scratch 설정
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- MP2 density 뽑아내기
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/09/03 14:28
Gaussian으로 MP2 계산을 해서 default로 나오는 전자밀도는 그냥 HF 파동함수로 구한 것이다. 따라서 MP2 방법에 의해서 correlation effect가 고려된 전자밀도를 구하고싶으면 아래와 같이 해야 한다. %chk=N.chk# MP2/aug-cc-pVTZ density=MP2 nitrogen ato..
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- 수소분자의 해리곡선 (dissociation curve)
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/08/29 16:01
양자화학 교과서에 흔히 나오는 예시인데, UHF는 RHF보다 constraint가 덜 걸려있기 때문에 더 낮은 에너지를 가지는 파동함수를 만들 수 있다는 것을 보여주기 위함이다. (그림 3.18에서 RHF나 UHF가 exact resul..
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- Gaussian Parser
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/08/17 01:20
여기서 output file의 이름이 $JOBID.out 이라고 생각하자. grep 'Converged?' $JOBID.out -A 4grep 'SCF Done' $JOBID.outgrep 'Frequencies' $JOBID.outgrep 'Optimization completed.' $JOBID.out 아래는 sed를 이용해서 Gaussian output 맨 마..
- Gaussian Parser
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- Gaussian 입문
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/08/14 23:29
- Gaussian 입문
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- Gaussian 연습 - transition state 찾기
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Komm, susser Tod! by highhill|2013/05/06 15:47
(A) CH3Cl + F- -> CH3F + Cl-(B) CH3Cl + Br- -> CH3Br + Cl- (A)를 계산하기 위한 input %Chk=opt_ts_1 # B3LYP/6-31G(d) Opt=(TS,calcfc,noeigentest) transition_..
- Gaussian 연습 - transition state 찾기
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- methyl trifluoroacetate와 trifluoromethyl acetate의 차이
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highhill by highhill|2013/04/27 01:15
어느 쪽의 carbonyl group이 더 active할까? 물론 이걸 알려면 transition state 계산을 해야겠지만, 약식으로 charge와 bond length만 보자. 계산 레벨은 간단히 B3LYP/6-31G(d,p)로 하고 geometry optimization을 수행했다. carbonyl C carbonyl O ester O F..
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- 지랄맞은 cubegen 사용법
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highhill by highhill|2013/04/24 14:43
분자오비탈을 보고싶을 때 cubegen 0 MO=39-42 CH3CF3_full.fchk CH3CF3_full.cube ESP map을 그리고 싶을 때는 전자밀도와 ESP 두 개의 cube를 만들어야 한다. cubegen 0 density=mp2 f2_mp2.fchk f2_mp2_DEN.cubecubegen 0 potential=mp2 f2_mp2.fc..
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- Triplet excitation energy 및 oscillator strength 계산
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highhill by highhill|2013/04/06 01:19
사실 이건 spin-orbit coupling이 없으면 아무리 정확한 계산법이라 해도 계산 못하는 게 맞다. Gaussian으로는 못한다는데, Dalton으로는 할 수 있는 모양이다. manual을 찾아보니까 Gaussian으로도 못하는 건 아닌데, 그 원소가 H부터 Cl까지로 한정되어있다: Wave..
- Triplet excitation energy 및 oscillator strength 계산
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- 편차치와 정규분포곡선에 대해서
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교주님의 무한의 大藏書館 by 교주님|2012/01/13 12:31
편차치와 정규분포곡선에 대해서 '편차치'라 하는 말은 우리나라보다 옆나라인 일본에서 주로 쓰이는 말입니다. 일본의 소설책이나 만화책, TV드라마, 그 외 수험 관련 책등에서 결코 빠지지 않고 나오는 말이..
편차치, 정규분포곡선, Gaussian, distribution, 점수
- 편차치와 정규분포곡선에 대해서
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- truncated normal distribution의 근사 (TrueSkill)
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헛된 위안 by dtcs|2011/04/26 09:53
마이크로소프트의 트루스킬이라는 rating system을 보면, truncated Gaussian이라는 함수가 필요해진다. 생긴 형태는 V(x) = φ(x) / Φ(x), φ(x)는 정규분포의 pdf 즉, φ(x) = exp(-x2/2) / sqrt(2π)이고, Φ(x)는 정규분포의 cdf, 즉 φ(x)..
- truncated normal distribution의 근사 (TrueSkill)
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- Gaussian Random Variable Code
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뜨거운머리 차가운 가슴 by hothead|2010/04/26 20:55
확률과 불규칙 신호론 시간에 잠깐 다루어 보았던 것. Standard Normal random variable double uniform_rv() { int j=1+(int)(100000.0*rand()/(RAND_MAX+1.0)); double value=(double)j/100000; return value; } double std_normal() /* normal ..
- Gaussian Random Variable Code
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